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清華顏寧研討組初次剖析NAT家屬卵白構(gòu)造

2015-04-07 17:12  來源:http://www.elinglong.com/  閱讀:

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清華顏寧研究組在天下上初次解析NAT家族蛋白結(jié)構(gòu)

相干結(jié)果頒發(fā)在《天然》雜志

  清華消息網(wǎng)3月22日電 3月20日,清華年夜學醫(yī)學院傳授、生命學院兼職教學顏寧和性命學院王佳偉副研究員配合引導(dǎo)的科研小組,在《做作》(Nature)揭橥了名為Structure and mechanism of the uracil transporter UraA(尿嘧啶轉(zhuǎn)運蛋白UraA的結(jié)構(gòu)和機制)的科研論文,活著界上初次解析了NAT(Nucleobase/Ascorbate Transporter,核苷堿基-維生素C轉(zhuǎn)運蛋白)家族蛋白UraA的晶體結(jié)構(gòu),由此處理了困擾寬大生物學家的一大困難。

  各類核苷堿基(nucleobases)以及維生素C的接收由一類跨膜轉(zhuǎn)運蛋白家族NAT蛋白介導(dǎo)。而他們經(jīng)過怎么的機制完成跨膜轉(zhuǎn)運,一直是個謎。核苷堿基-維生素C轉(zhuǎn)運(NAT)蛋白家族,又稱為核苷堿基-陽離子同向轉(zhuǎn)運載體2(NCS2)蛋白家族,在各種生物核苷堿基攝取的生理運動中發(fā)揮側(cè)重要作用。核苷堿基作為DNA、RNA的重要構(gòu)成成份,是各種生物必須的分子,總裁培訓班,而維生素C則在人類安康中起著癥結(jié)的作用,家喻戶曉,維生素C的攝取缺乏會致使壞血病。因而,知曉NAT家族蛋白的三維結(jié)構(gòu)信息和其施展生理活性的機制結(jié)構(gòu)相當重要。顏寧研究組此次剖析UraA的晶體結(jié)構(gòu)及其機制則發(fā)表了這一答案。

圖為UraA三維晶體結(jié)構(gòu)

圖為UraA轉(zhuǎn)運機制模子

  該科研小組研討職員經(jīng)由構(gòu)造剖析,發(fā)現(xiàn)UraA在空間排布上浮現(xiàn)兩個顯明的結(jié)構(gòu)域,即中心結(jié)構(gòu)域跟門控結(jié)構(gòu)域。在已有的結(jié)構(gòu)基本上,他們經(jīng)過大批的體內(nèi)體外生化試驗進一步證實了該卵白特別結(jié)構(gòu)的心理意思:蛋白底物尿嘧啶在跨膜轉(zhuǎn)運的過程當中起首被正確地定位在兩個結(jié)構(gòu)域之間,進而經(jīng)由過程核心結(jié)構(gòu)域和門控結(jié)構(gòu)域之間的構(gòu)像變更實現(xiàn)全部轉(zhuǎn)運進程。他們還發(fā)明了在底物辨認共轉(zhuǎn)運中起要害感化的數(shù)個氨基酸?蒲行〗M依據(jù)序列比擬,進一步提出了NAT家屬應(yīng)用鈉離子或質(zhì)子共轉(zhuǎn)運底物的份子機理。

  顏寧教授帶領(lǐng)的科研小組自樹立以來即努力于對膜轉(zhuǎn)運蛋白結(jié)構(gòu),特殊是養(yǎng)分物資——質(zhì)子共轉(zhuǎn)運蛋白的結(jié)構(gòu)與分子機理的研究。他們在2007年開端了對NAT家族蛋白的研究,首先拔取了大腸桿菌尿嘧啶-質(zhì)子共轉(zhuǎn)運蛋白(Uracil:proton Symporter)UraA這一該家族代表性成員作為研究工具,利用古代結(jié)構(gòu)生物學的方式,終究在2010年4月初次取得了UraA與底物尿嘧啶高達2.8埃的高辨別率三維精致結(jié)構(gòu)。通過對三維晶體結(jié)構(gòu)的分析,他們欣喜地發(fā)現(xiàn):在領(lǐng)有由14個跨膜片段構(gòu)成的兩個反向反復(fù)序列的UraA蛋白中,存在著一種全新的蛋白折疊情勢。在第3號和第10號跨膜片斷間存在著一對反向平行的beta-折疊片,它們在蛋白結(jié)構(gòu)的保持和蛋白底物的識別中發(fā)揮了重要作用。

  這一發(fā)現(xiàn)基礎(chǔ)推翻了始終以來對膜整合蛋白結(jié)構(gòu)的認知。從前25年的膜蛋白結(jié)構(gòu)生物學研究仿佛表白,膜整合蛋白的跨膜區(qū)或只要alpha螺旋,或許只要beta折疊。獨一的破例是S2P蛋白,其在膜邊沿處另有三個beta折疊,因為是出于蛋白邊緣,還一度被專家質(zhì)疑是不是是因為體外結(jié)晶釀成的結(jié)構(gòu)變相。而UraA的結(jié)構(gòu)毫無疑義地證明這alpha螺旋和beta折疊兩種蛋白二級結(jié)構(gòu)能夠在膜蛋白的跨膜區(qū)中同時存在,這一發(fā)現(xiàn)為研究膜蛋白的折疊和退化供給了主要線索。

  據(jù)悉,這是清華大學結(jié)構(gòu)生物學核心自2009年4月以來,作為通信作者發(fā)的第10篇《天然》、《迷信》、《細胞》論文。

  附:文章揭曉鏈接:

供稿:醫(yī)學院 編纂:露 英


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